Alcuni batteri producono e assorbono il loro cibo, mentre altri devono consumare sostanze come organismi viventi o materiale in decomposizione attraverso le loro pareti cellulari. I batteri abbattono il cibo in un processo chiamato respirazione, che per alcuni ceppi di i batteri richiedono l'ossigeno per completare.
Molti tipi di batteri sono in grado di mangiare una varietà di cose come latte, carne, olio e gas. Alcuni batteri vivono nei tratti digestivi dell'uomo e di altri animali e aiutano il corpo ad aiutare a digerire il cibo e a mangiare altri batteri nocivi. L'Escherichia coli, più comunemente noto come E. coli, è un batterio che vive nel corpo umano e sopravvive digerendo il cibo, assorbendo parte dei nutrienti e liberando la vitamina K. La versione dannosa del batterio E. coli fa sì che le persone si ammalino se ingerito.
Per mangiare, alcuni batteri assorbono il cibo attraverso le pareti cellulari. Molti sono autotrofi, nel senso che fanno il loro cibo usando cose come la luce solare, l'acqua e il suolo, in modo simile al metodo di fotosintesi usato da molte piante. Assorbono il cibo che producono e rilasciano ossigeno nell'aria.
I batteri sono anche usati per fare cibo come formaggi e yogurt. Mangiano gli zuccheri del latte e li convertono in acido lattico, con formaggi più morbidi che hanno più batteri del formaggio a pasta dura.