Poiché le stesse amebe sono microscopiche, possono solo ingerire altre particelle alimentari microscopiche, come alghe, batteri, piante in decomposizione o materia animale e altri organismi a singola cellula. Le particelle di cibo grandi sarebbero impossibili per le amebe digerire. L'ameba si nutre attaccandosi all'oggetto adatto, quindi circondando e inghiottendo il cibo all'interno del corpo dell'ameba.
Per afferrare la particella alimentare, l'ameba usa una parte del corpo conosciuta come pseudopodo, che può estendersi dalla parte principale del suo corpo. Lo pseudopode è probabilmente la parte più importante della cellula dell'ameba, poiché l'organismo si muove anche allungando questa parte del corpo per tirarsi su. L'altra parte principale della cellula è il citoplasma, una sostanza liquida simile alla gelatina che riempie la cellula.
Quando l'ameba trascina il cibo nel suo corpo, il citoplasma all'interno della cellula circonda la particella alimentare e la immagazzina con una goccia d'acqua nel vacuolo alimentare. Il citoplasma secerne gli enzimi digestivi nel vacuolo alimentare che abbatte le parti più morbide della preda. Quando ciò accade, i nutrienti solubili vengono assorbiti nel citoplasma. Man mano che l'ameba si sposta in avanti, il citoplasma rilascia le parti che non sono state dissolte.