Gli agenti atmosferici biologici sono l'effetto che gli organismi viventi, come le piante e gli animali, hanno sulle rocce e altri oggetti inanimati. Questo fenomeno si verifica a causa della decomposizione molecolare dei minerali nella roccia. Quando si verifica l'alterazione biologica, l'organismo vivente distrugge la roccia o altri oggetti non viventi attraverso l'erosione meccanica o chimica o l'uso di entrambi.
Un esempio di agenti atmosferici meccanici biologici sono le radici degli alberi che crescono attraverso una roccia, facendola lentamente a pezzi o rompendo la roccia in pezzi. Una volta che le radici degli alberi creano i fori per il passaggio delle radici, le radici possono sanguinare i nutrienti dalla roccia. Un altro esempio è un animale che secerne un acido o si piega in una roccia lentamente erodendo lo spazio e scivolando dentro di esso. Entrambi questi metodi funzionano per dissolvere la roccia nel tempo. Organismi come batteri, alghe e licheni secernono sostanze chimiche che lavorano per abbattere le rocce su cui vivono. Ciò prevede la lenta dissoluzione della roccia mentre l'organismo sta ancora tirando i nutrienti di cui ha bisogno per sopravvivere dalla roccia. Organismi come muschi, licheni e alghe si trovano principalmente vicino a fonti d'acqua dove il clima è umido, umido e ombreggiato. In questo tipo di clima l'organismo può crescere senza impedimenti.