Un anaerobio aerotollerante è un organismo che tollera la presenza di ossigeno ma non lo richiede per la crescita . Invece, gli anaerobi aerotolleranti usano la fermentazione per sopravvivere. Un esempio di organismo è il lactobacillus, un batterio che vive nell'intestino degli esseri umani ed è anche usato nella produzione di yogurt.
Il processo di fermentazione comporta la conversione dello zucchero in acidi, zucchero e /o etanolo, come modo di formare energia. Esistono molti percorsi di fermentazione che vengono utilizzati, più comunemente attraverso l'acido lattico. I funghi come i lieviti tendono a utilizzare la fermentazione di etanolo. Questo processo rilascia meno energia rispetto ai metodi aerobici, poiché si basa sulla rigenerazione dell'ATP da ADP.
