Un organismo non patogeno è un organismo che non provoca malattie se consumato o mentre vive in un organismo ospite. Gli organismi che possono causare malattie e malattie sono noti come "patogeni".
Non solo gli organismi non patogeni sono innocui per i loro ospiti, possono effettivamente essere utili. Alcune ricerche hanno dimostrato che i batteri non patogeni possono inibire la crescita e la riproduzione dei batteri nocivi, secondo MedicineNet. Molti organismi non patogeni possono anche vivere nel tratto intestinale dell'uomo e di altri animali per lunghi periodi di tempo senza causare malattie o interruzioni. Questi organismi includono protozoi non patogeni come Chilomastix mesnili, Endolimax nana e Entamoeba coli.