Le appendici mancanti, i serpenti hanno corpi semplici composti da testa, corpo e coda. Inoltre, alcuni serpenti esibiscono un restringimento immediatamente dietro la testa, che dà loro anche un collo distinguibile. Alcuni lignaggi di serpenti primitivi, come boa e pitoni, hanno conservato la loro cintura pelvica. Ispezionare la coda di questi serpenti rivela piccoli artigli o speroni, che sono i resti delle zampe posteriori una volta attaccate ai loro pelvi.
I serpenti hanno diverse parti del corpo uniche. L'apertura al tratto intestinale di un serpente è chiamata sfogo. Lo sfiato è identificato notando una grande scala semicircolare vicino all'estremità posteriore del serpente. La coda di un serpente inizia dalla bocca e si estende fino alla fine del suo corpo. Diverse specie hanno evoluto diversi tipi di code. Le specie arboree, come i pitoni degli alberi verdi, hanno code eccezionalmente lunghe che aiutano a tenere i rami. Al contrario, le specie terrestri, come i Kingsnakes, hanno una coda relativamente corta. I serpenti a sonagli hanno evoluto le code che producono un rumore quando vengono scossi.
I serpenti non hanno aperture per le orecchie esterne, sebbene abbiano poche strutture dell'orecchio interno. I serpenti non hanno le palpebre; invece, hanno delle scale chiare, chiamate spettacoli, per coprire i loro occhi. Questo protegge i loro occhi e impedisce loro di asciugarsi. Molti boa e pitoni hanno delle fossette sulle squame delle labbra, che consentono loro di rilevare il calore dal loro ambiente.