Pitagora fu educato a Tiro, Samo e Mileto, che è l'odierna Siria e Asia Minore, così come l'Egitto. In seguito fondò la sua propria scuola di mistero a Crotone, che è l'Italia meridionale.
Da giovane sull'isola di Samos, la prima educazione di Pitagora comprendeva in gran parte l'apprendimento della lira e la recitazione di poesie di autori come Omero. Si pensa anche che sia stato educato dai caldei e dai saggi siriani durante i viaggi con suo padre a Tiro.
I suoi principali insegnanti da giovane sono considerati i filosofi Pherekydes, Thales e Anassimandro, questi ultimi due sono insegnanti e studenti che vivono a Mileto.
Intorno al 535 a.C., Pitagora studiò in Egitto nel tempio di Diospolis, o nell'antica Tebe, ora Luxor di oggi.