Il principio di Hardy-Weinberg afferma che la variazione genetica in una popolazione rimane costante per generazioni in assenza di fattori distruttivi. Il concetto prevede che quando l'accoppiamento avviene casualmente in una vasta popolazione, l'allele e le frequenze genotipiche rimangono coerenti perché sono in equilibrio.
L'equilibrio di Hardy-Weinberg può essere sovvertito da una varietà di fattori esterni, tra cui selezione naturale, pratiche di accoppiamento, flusso genico, mutazioni e deriva genetica. Ad esempio, le mutazioni minano l'equilibrio delle frequenze alleliche attraverso la presentazione di nuovi alleli in una popolazione. La selezione naturale sovverte il modello di equilibrio di Hardy-Weinberg perché cambia le frequenze del gene. Il principio di Hardy-Weinberg raramente esiste in realtà perché i fattori di disturbo sono comunemente presenti in natura.