I substrati di base per la tripsina sono proteine alimentari, secondo Worthington Biochemical Corporation. La tripsina è un enzima digestivo secreto dal pancreas. La tripsina separa le grandi proteine alimentari dai loro legami peptidici, rompendole in catene polipeptidiche più piccole.
Durante la digestione, la tripsina viene secreta nella sezione duodenale dell'intestino tenue attraverso il dotto pancreatico. Secondo la RSCB Protein Data Bank, la tripsina agisce principalmente vicino agli aminoacidi lisina e arginina in grandi catene proteiche. Durante il processo digestivo, questi segmenti di proteine recisi sono ulteriormente influenzati da ulteriori enzimi digestivi, che alla fine producono singoli amminoacidi. Questi piccoli amminoacidi vengono assorbiti attraverso il rivestimento dell'intestino tenue e nel flusso sanguigno.