La differenza tra fluoruro stannoso e fluoruro di sodio è che solo il primo uccide i batteri, mentre entrambi hanno dimostrato di ricostruire lo smalto. Il fluoruro stannoso ha anche lo svantaggio di macchiare i denti quando è incluso in un composto che contiene stagno.
Il fluoruro stannoso era un ingrediente aggiunto al dentifricio negli anni '50 fino a quando fu sviluppata l'alternativa più gustosa ed economica, il fluoruro di sodio. Il fluoruro stannoso è utile per le persone le cui ghiandole salivari non producono abbastanza saliva. La saliva è importante perché aiuta a proteggere dall'acidità e dalla carie. Il fluoruro stannoso deve essere applicato dopo la spazzolatura, una volta al giorno o come indicato dal dentista e lasciato in posa per 30 minuti prima che il paziente riprenda a mangiare o bere. Non dovrebbe essere usato come un normale dentifricio. I pazienti devono dire al proprio dentista o al farmacista eventuali allergie che hanno prima di usare questo prodotto e riportare qualsiasi storia di piaghe alla bocca.
Il fluoruro di sodio, che è presente in molti dentifrici commerciali, può anche essere usato come integratore orale. In questo caso, il consumatore dovrebbe fare attenzione a superare il dosaggio giornaliero raccomandato da varie fonti combinate. Poiché il fluoro è aggiunto all'acqua potabile di molte comunità, il governo ha emanato linee guida sull'assunzione di fluoro per neonati, bambini, adolescenti e adulti.