Gli organismi strettamente correlati spesso condividono strutture simili nei loro corpi, nonostante i loro diversi stili di vita. La spiegazione più semplice di tali somiglianze è che entrambe le specie discendono da un antenato comune con caratteristiche simili. Questo a volte è verificato dalla documentazione fossile.
Le somiglianze anatomiche tra i diversi gruppi di organismi, alcuni dei quali vivono in ambienti diversi dagli altri, sostengono fortemente la teoria della discendenza comune. I delfini, ad esempio, vivono come grandi pesci predatori, ma la loro somiglianza con il pesce è superficiale. Come tutti i mammiferi placentati, i delfini hanno polmoni e semplici mascelle e gestiscono internamente i loro piccoli. La spiegazione più semplice di queste somiglianze con cani, gatti e primati è che i delfini sono più strettamente legati ad altri mammiferi di quanto non lo siano per il pesce in cui vivono. Un altro esempio di anatomia analoga tra le specie è l'arto tetrapode. La forma base di questa struttura è un singolo osso lungo attaccato ad una spalla ad un'estremità e un gomito all'altro. Sotto il gomito, due ossa più piccole si estendono fino a un polso, che termina in piccole ossa per le dita delle mani e dei piedi. Questa struttura è universale tra mammiferi, uccelli, rettili e anfibi, ma sconosciuta tra gli invertebrati. La spiegazione più parsimoniosa di questo fatto è che tutti i tetrapodi discendevano da animali con arti simili ma che gli insetti no.