I due gruppi funzionali che si trovano sempre negli amminoacidi sono gruppi carbossilici e amminici. Entrambi i gruppi sono acidi. Un legame peptidico si verifica quando il gruppo carbossilico di un amminoacido si unisce all'estremità amminica di un altro.
Un gruppo carbossilico consiste di un atomo di carbonio, due atomi di ossigeno e un atomo di idrogeno. Il gruppo amminico consiste di un atomo di azoto e due atomi di idrogeno. I gruppi carbossile e amminico si trovano alle estremità opposte di un amminoacido.
Due amminoacidi formano un legame peptidico o ammidico quando si uniscono. Le estremità amminiche e carbossiliche dei due amminoacidi si uniscono e l'azoto del gruppo amminico si lega al carbonio del gruppo carbossilico. Gli idrogeni sul gruppo amminico e un ossigeno sul gruppo carbossile si combinano per formare una molecola di acqua.
