Una delle più gravi debolezze dell'esercito dell'Unione era la mancanza di generali esperti. La maggior parte delle università militari erano situate negli stati confederati. Di conseguenza, Lincoln si ritrovò a comandare generali che non potevano capitalizzare sulle debolezze dell'esercito confederato.
Un altro grande svantaggio del Nord è stato il fatto che stavano invadendo un territorio sconosciuto. I generali del Sud conoscevano la posizione della terra e sapevano come molestare le truppe dell'Unione, mentre i generali del Nord non avevano familiarità con la zona. Anche i soldati del Nord hanno dovuto affrontare un nemico che aveva un morale molto alto perché stavano difendendo le loro case. Infine, gli obiettivi dell'esercito dell'Unione, sia politici che militari, erano molto vasti e molto più difficili da realizzare rispetto a quelli dei confederati.
Tutti gli stati confederati dovevano sopravvivere fino alla fine della guerra, mentre l'esercito dell'Unione doveva invadere, conquistare e poi sottomettere il nemico. Hanno dovuto prendere il fiume Mississippi dal sud per impedire le linee di rifornimento occidentali. Anche il Nord ha dovuto tagliare il Sud dai commercianti internazionali e fermare la produzione di forniture di guerra da parte del Sud. Alla fine, il Nord dovette impedire all'Esercito confederato di invadere il nord per fare pressione sulle prime perdite del Nord.