Lewis e Clark hanno attraversato la catena montuosa di Bitterroot, un segmento settentrionale delle Montagne Rocciose. Anche se le vette dei Bitterroot sono in media da 9.000 a oltre 11.000 piedi, hanno trovato una rotta verso ovest attraverso le montagne attraverso Lolo Pass, che si trova ad un'altezza di 5,236 piedi.
Uno degli obiettivi principali della spedizione di Lewis e Clark era la ricerca del passaggio a nord-ovest, un'ipotetica rotta d'acqua dall'Oceano Atlantico all'Oceano Pacifico. Altri obiettivi includevano il contatto diplomatico con i nativi americani, l'estendersi del commercio di pellicce in nuovi territori e l'esplorazione del fiume Missouri, del Pacifico nord-occidentale e dell'acquisto della Louisiana da poco acquistato. Stabilirono il fiume Missouri nel maggio 1804 con altri 33 uomini. Nel North Dakota hanno costruito Fort Mandan all'interno del quale attendere l'inverno. Nell'aprile del 1805, continuarono lungo il Missouri fino a raggiungere le Montagne Rocciose, dove dovettero continuare a cavallo. Dall'altra parte del Continental Divide, hanno continuato in canoa lungo i fiumi Clearwater e Snake fino a raggiungere il fiume Columbia, che li ha portati fino al Pacifico.
Lewis e Clark e gli uomini della loro spedizione, chiamati il Corpo di Scoperta, arrivarono a St. Louis nel settembre del 1806 dopo aver viaggiato per quasi 8.000 miglia. Sono stati ricevuti come eroi dal presidente Thomas Jefferson, dal Congresso e dal pubblico americano.