Alcuni dei microrganismi più dannosi per l'umanità sono Staphylococcus aureus, Escheria coli, Enterococcus faecium e Pseudomonas aeruginosa. I microrganismi che causano la malattia sono indicati come agenti patogeni.
Tutti i batteri, la maggior parte dei protozoi e alcuni funghi sono microrganismi. Il termine "microrganismi" è usato per indicare una forma di vita che non è visibile all'occhio umano senza l'aiuto di un microscopio. Queste possono essere una singola cella o composte da molte celle. Ci sono microrganismi in ogni tipo di ambiente sulla Terra, ma ci sono microrganismi più benefici di quelli nocivi. L'ingegneria genetica implica la manipolazione di microrganismi per creare caratteristiche specifiche in organismi più grandi.