Il profilo del DNA ha il vantaggio di aiutare a identificare potenziali malattie genetiche e ad aiutare i funzionari delle forze dell'ordine a identificare i criminali. Gli svantaggi del profilo del DNA includono la possibilità di errore e il potenziale per l'informazione da utilizzare a scopi nefandi.
Il profilo del DNA è spesso usato da coppie che stanno considerando di avere figli ma sono preoccupati per le malattie genetiche. Permette a queste coppie di determinare il rischio che i loro figli nascano con queste malattie e può aiutare a evitare una grande quantità di sofferenza. Tuttavia, il rischio di errore in questi risultati del test può far sì che le coppie prendano decisioni basate su informazioni false.
Anche il profilo del DNA viene spesso utilizzato a fini di contrasto. Permette alla polizia di identificare in modo affidabile i sospetti e può aiutare a eliminare persone innocenti da un gruppo di sospetti. L'avvento di una più affidabile analisi del DNA ha aiutato la polizia a risolvere gli omicidi decenni dopo che si sono verificati. Ha anche scagionato persone innocenti che sono state condannate ingiustamente.
Tuttavia, vi sono preoccupazioni sulla privacy e su come questi dati vengono utilizzati. Alcune persone temono che i governi possano usare i record del DNA per discriminare i gruppi che considerano indesiderabili. Le informazioni sono archiviate in database informatici, quindi potrebbero essere vulnerabili agli hacker. La profilazione del DNA può anche essere suscettibile di errori o contaminazione che provocano una falsa corrispondenza, implicando una persona innocente. Può anche essere piantato nelle scene del crimine e rendere quasi impossibile per un innocente cancellare il suo nome.