Lo iodio reagisce con l'amido presente nelle cellule di cipolla, producendo una colorazione che rende le cellule facilmente visibili al microscopio. Le cellule di cipolla sono naturalmente trasparenti, quindi è difficile visualizzarle correttamente senza usare un soluzione per aumentare il contrasto.
Per ottenere un'immagine chiara delle cellule di cipolla, è necessario preparare prima un campione di microscopio a montaggio a umido. La persona che prepara il campione deve mettere una goccia d'acqua su un vetrino da microscopio pulito, quindi posizionare un pezzo di buccia di cipolla su di esso. Per garantire il contrasto, viene aggiunta una goccia di soluzione di iodio. Il campione viene quindi protetto con un vetrino coprioggetto e osservato al microscopio. Se il campione contiene una maggiore quantità di amido, l'aggiunta di iodio crea una colorazione blu.