Esistono diverse differenze chiave tra cellule vegetali e animali, come struttura della parete cellulare, presenza o assenza di plastidi, lisosomi e centrioli e forma dei vacuoli. Queste caratteristiche sono le differenze principali e più distinte tra cellule vegetali e animali. Tuttavia, esistono solo in organismi classificati come eucarioti e si trovano principalmente negli organelli centrali.
La struttura della parete cellulare varia considerevolmente tra le cellule vegetali e quelle animali. Nelle cellule vegetali, le pareti hanno forma ma mancano di una struttura chiaramente definita e rigida; i biologi si riferiscono a questo come avere muri quasi presenti. Le cellule animali, d'altra parte, non hanno pareti cellulari presenti al di fuori delle loro membrane cellulari. Nelle cellule vegetali, i plastidi si trovano nel citoplasma mentre le cellule animali non hanno plastidi. La maggior parte delle cellule animali contiene lisosomi, che si trovano principalmente nei loro citoplasmi. Le cellule vegetali in genere non hanno lisosomi; se lo fanno, quelle strutture si trovano anche nei loro citoplasmi. Organelli chiamati centrioli si trovano in alcune cellule vegetali, ma si trovano solo nelle cellule di varietà vegetali inferiori. Centrioli si trovano in tutte le cellule animali, tuttavia. L'ultima differenza primaria tra cellule vegetali e animali è che tutte le cellule vegetali contengono strutture chiamate vacuoli, che sono riempite con linfa cellulare simile a gel. Alcune cellule animali contengono anche vacuoli; se presenti, quei vacuoli sono temporanei o piccoli e contrattili.
