Il cibo che non viene digerito correttamente nello stomaco viene alla fine spinto attraverso il resto del tratto gastrointestinale ed esce dal corpo attraverso il retto come sgabello. Il corpo tratta il cibo non digerito come qualsiasi altra sostanza che lo stomaco non riesce ad abbattere.
L'incapacità del corpo di estrarre completamente i nutrienti dal cibo è noto come malassorbimento. Ciò può verificarsi a causa di una carenza o interruzione degli enzimi digestivi. I sintomi del malassorbimento comprendono diarrea, perdita di peso e feci sgradevolmente grandi e dall'odore sgradevole. I medici verificano il possibile malassorbimento esaminando le feci per il grasso. In alcuni casi è necessaria una biopsia dell'intestino tenue.