Anche se le varie teorie sulla causa dell'11 settembre variano ampiamente e includono la tesi dei teorici della cospirazione che era un lavoro interno del governo degli Stati Uniti, la maggior parte della gente crede che fosse destinata a protestare contro il sostegno degli Stati Uniti Israele e la sua presenza militare in Medio Oriente in generale. Gli attentatori erano presumibilmente terroristi islamici di varie nazioni del Medio Oriente finanziati da Osama bin Laden. Ognuno dei 19 dirottatori che insieme hanno preso il controllo di quattro aerei commerciali intenti agli attacchi suicidi sono stati associati direttamente al gruppo terrorista di Al-Qaida di bin Laden.
Bin Laden ha dichiarato una guerra santa contro gli Stati Uniti nel 1998. A quel tempo, ha chiesto l'assassinio di civili americani in una fatwa che ha firmato. Diversi studiosi del Medio Oriente ritengono che il 911 fosse il modo di bin Laden di provocare gli Stati Uniti in una guerra che avrebbe incitato i musulmani di tutto il mondo a unirsi in opposizione all'Occidente.
I critici del governo federale sostengono che il fallimento di contrastare l'11 settembre è stato il risultato del governo statunitense che non ha condiviso informazioni tra le sue varie agenzie di intelligence, molte delle quali avevano avanzato l'allarme su porzioni della trama dell'11 settembre.
Altri incolpano la sicurezza dell'aeroporto, sottolineando il fatto che i terroristi hanno contrabbandato con successo coltelli e tagliacarte su aerei in tre aeroporti sulla costa orientale.
