Il pKa di un amminoacido dipende dal tipo, dal gruppo e dalle catene laterali. Ad esempio, quando la lisina fa parte del gruppo acido carbossilico, ha un pKa di 2,18, rispetto a un pKa di 8,95 quando fa parte del gruppo amminico e 10,53 con catene laterali.
Quando nel gruppo acido carbossilico, la maggior parte degli amminoacidi ha valori di pKa di poco più di 2, con solo istidina che scende al di sotto con un pKa di 1,77. Un acido con un valore di pKa inferiore a 2 è considerato un acido forte, mentre quelli sopra sono considerati acidi deboli. Gli amminoacidi nel gruppo amminico hanno valori di pKa che vanno dagli 8 alti ai 10 bassi.
