La differenza essenziale tra meiosi I e meiosi II è apposta. Meiosi I è dedicata alla formazione di due cellule aploidi da una cellula diploide, mentre la meiosi II è destinata a dividere i cromatidi fratelli nell'aploide cellule prodotte nella meiosi I, creando quattro cellule figlie. La meiosi I ricombina, o mescola, i geni su ogni coppia di cromosomi. Meiosi I e meiosi II si verificano in successione.
La grande maggioranza delle cellule nel corpo di un organismo è diploide; contengono due coppie di ogni cromosoma. I cromosomi sono le strutture fisiche su cui si trovano i geni. Tuttavia, ai fini della riproduzione sessuale, sono necessarie cellule aploidi che contengono solo una copia di ciascun cromosoma. Altrimenti, la progenie prodotta avrebbe troppi cromosomi e non potrebbe sopravvivere.
Meiosis I mescola i geni sui cromosomi dei genitori per aiutare a garantire la diversità genetica, e quindi separa ogni coppia di cromosomi in due nuove cellule figlie. Ciascuno di questi cromosomi è composto da due cromatidi che, a causa della ricombinazione, portano diverse combinazioni dei geni del genitore. Lo scopo della meiosi II è quello di dividere ogni cromatide, producendo quattro cellule aploidi. Queste quattro celle sono chiamate gameti.
Ad esempio, gli esseri umani trasportano 46 cromosomi nelle loro cellule non riproduttive. La meiosi I nell'uomo produce due cellule aploidi con 23 cromosomi o coppie di cromatidi e la meiosi II divide quelle cellule in quattro nuove cellule, ciascuna delle quali contiene 23 cromatidi. Questi gameti sono meglio conosciuti come cellule spermatiche e cellule di uova nell'uomo. Quando si fondono durante la riproduzione sessuale, formano una cellula, chiamata zigote, che è diploide ancora una volta con 46 cromosomi. Il mescolamento dei geni che si verifica durante la meiosi e il mescolamento dei geni dei genitori durante la riproduzione sessuale contribuiscono a garantire la diversità genetica in una specie.