La sequenza Shine-Dalgarno è una disposizione specifica di nucleotidi ricchi di purine nell'mRNA procariotico che indirizza l'RNA a una piccola subunità ribosomiale per la traduzione. Questa sequenza è necessaria per il legame ribosomiale e la sintesi proteica si verifica nelle cellule procariotiche. È anche noto come sito di rilegatura ribosomiale.
La sequenza Shine-Dalgarno si trova a monte da dove avviene la traduzione dell'mRNA in proteine, nella regione 5 'non tradotta o 5' UTR. Esistono molteplici disposizioni di nucleotidi che possono indirizzare l'mRNA procariotico ai ribosomi affinché la traduzione avvenga e sequenze multiple di Shine-Dalgarno sono state descritte dagli scienziati. Tipicamente, la sequenza è vista approssimativamente da otto a 10 codoni a monte del codone di inizio AUG che segnala l'inizio della traduzione dell'mRNA procariota. Nonostante ci siano più sequenze Shine-Dalgarno, condividono tutti una sequenza di consenso di sei nucleotidi in un ordine specifico: AGGAGG.
L'introduzione di mutazioni alla sequenza Shine-Dalgarno può avere effetti diversi a seconda del tipo di mutazione e della sua posizione. Una mutazione della sequenza può aumentare la velocità di traduzione, diminuire la frequenza o non avere impatto.
La sequenza Shine-Dalgarno è stata descritta per la prima volta dagli scienziati australiani John Shine e Lynn Dalgarno. La sequenza è stata anche vista in archaea.
