I due principali tipi di respirazione anaerobica sono la fermentazione alcolica e la fermentazione dell'acido lattico. Questi metodi di respirazione si verificano quando la quantità di ossigeno disponibile è troppo bassa per supportare la respirazione aerobica.
La fermentazione alcolica converte il glucosio in etanolo. Nella fermentazione alcolica, il glucosio viene scomposto dalla glicolisi e nel processo vengono rilasciate due molecole di ATP. Le molecole di acido piruvico prodotte durante la glicolisi si scindono in etanolo e anidride carbonica. Negli animali, il processo di fermentazione dell'acido lattico, analogamente, si verifica dopo il processo di glicolisi. L'acido piruvico viene trasformato in acido lattico e il tessuto muscolare viene metabolizzato dall'acido lattico. La fermentazione dell'acido lattico è la ragione per cui i muscoli bruciano durante un allenamento intenso o prolungato. La disgregazione dell'acido lattico dei muscoli fa sì che il tessuto muscolare si ricostruisca per diventare più forte.