Le teorie su ciò che è successo alla colonia Roanoke vanno dai coloni che muoiono di malattia a essere uccisi dalle tribù native americane. Un'altra teoria prevalente è che i coloni abbandonarono Roanoke.
Ciò che si sa della colonia di Roanoke è che la colonia era composta da 17 donne, 11 bambini e 90 uomini. La presenza di donne e bambini implica che l'intenzione di questo gruppo di andare nel Nuovo Mondo era stabilirsi e iniziare una nuova vita lì, lontano dall'Inghilterra.
Quando fu scoperta la colonia di Roanoke, non vi furono tracce dei coloni che vi si stabilirono. Questo porta alla prima teoria su Roanoke.
La teoria prevalente è che poiché non c'erano colonizzatori trovati vicino alla colonia di Roanoke, i coloni devono averlo abbandonato. Riguardo a dove i coloni andarono dopo aver abbandonato la colonia, i ricercatori credono che i coloni abbiano attraversato la Carolina del Nord, utilizzando principalmente il suono di Albemarle e il fiume Chowan, e si unirono a una delle tante tribù incontrate lungo il cammino.
Altre teorie sono che i coloni sono caduti in malattia causata da microbi del Nuovo Mondo a cui i loro corpi non erano mai stati esposti prima o che i nativi americani hanno ucciso i coloni. In ogni caso, i ricercatori concordano sul fatto che i coloni si siano separati e questo alla fine porterà alla loro scomparsa.
