Malattie che affliggevano i primi coloni americani includevano tifo, noto anche come febbre tifoide o febbre da macero, oltre a malaria ed encefalite. Dissenteria e ipernatremia altrimenti noti come avvelenamento da sale hanno anche messo in evidenza una salute degli americani coloniali.
Il vaiolo era anche una minaccia sinistra in quel momento. Un'epidemia di vaiolo nel coloniale di Williamsburg dal 1747 al 1758 colpì 754 persone. Grandi popolazioni di nativi americani sono state spazzate via durante il periodo coloniale quando hanno contratto malattie come il vaiolo. Le epidemie di malattia introdotte in Europa hanno ridotto la popolazione di nativi americani nel New England del 90% tra il 1615 e il 1633.
