Panera Bread modifica il menu del pranzo offrendo opzioni giornaliere di zuppa e la catena di ristoranti offre anche opzioni di menu nuove e di ritorno ogni primavera, estate, autunno e inverno. Ogni giorno Panera presenta sette zuppe con due su un programma rotante.
Ogni domenica, martedì, giovedì e sabato, le alternative di zuppa alternative sono la zuppa di fagioli neri vegetariana a basso contenuto di grassi e la zuppa di pollo e zuppa di riso selvatica, a partire dal 2015. Ogni lunedì e mercoledì, sono zuppa di patate al forno e basso Zuppa di verdure grassa vegetariana con pesto. Ogni venerdì vengono aggiunte al menu la minestra vegetariana a basso contenuto di grassi con pesto e zuppa di molluschi del New England.
I menu stagionali offrono oggetti come la papavero alla fragola e l'insalata di pollo in primavera e in estate, i ravioli Butternut Squash in autunno e la farina d'avena di quinoa mandorlata durante l'inverno.