I morsi di bagel dovrebbero essere cotti nel microonde per due minuti e 20 secondi. Dovrebbero essere lasciati riposare per un minuto prima di mangiarli.
I morsi di bagel possono anche essere cucinati in un forno. Dovrebbero essere collocati in un forno che è stato preriscaldato a 450 gradi Fahrenheit. Le varietà di mozzarella e tre formaggi devono essere cotte solo per 12 minuti. Tutti gli altri tipi dovrebbero essere cotti per 14 minuti.
Un forno tostapane può essere utilizzato anche per cucinare i morsi Bagel. Il tostapane deve essere preriscaldato a 400 gradi Fahrenheit. I morsi di bagel dovrebbero essere cotti per 14 minuti.