Secondo About.com, tapioca contiene zero grammi di grassi e proteine, che lo rendono un amido naturale sano estratto dalla radice di manioca. Tapioca è anche senza glutine, che consente di essere un un'alternativa sana per coloro che soffrono di celiachia.
L'Huffington Post riporta che la tapioca usata nel tè boba può avere bifenili aspoliclinati, una sostanza chimica legata al cancro e che può avere effetti avversi sui sistemi nervoso, endocrino, immunitario e riproduttivo. La sostanza chimica non ha alcun uso nella tapioca naturale, è un materiale creato dall'uomo ed è vietata negli Stati Uniti. La tapioca contaminata era legata ai produttori di Taiwan. I principali produttori di tapioca hanno contestato il risultato, dichiarando i metodi di test fuorvianti.