L'ultimo negozio di Fanny Farmer è stato chiuso nei primi anni 2000. La catena fu fondata nel 1919 da Frank O'Connor, un uomo d'affari canadese e fondatore della Laura Secord Candy Shops di Toronto. Il primo negozio di Farmer è stato aperto a Rochester, New York.
Il nome dell'azienda deriva dal creatore della scuola di cucina di Boston, Fannie Farmer. La società è cresciuta fino a oltre 400 negozi. Alcuni dei suoi prodotti più venduti erano creme al burro, caramelle di noce d'acero, barrette di parfait, corteccia di mandorle e creme all'arancia. Fanny Farmer ha fatto bene durante la Grande Depressione. Durante la seconda guerra mondiale, il razionamento negli Stati Uniti ha permesso alla compagnia di inviare molti dei suoi prodotti ai soldati all'estero.
Nel 1962, un gruppo di investitori di New York e New England ha preso il controllo e Fanny Farmer è cresciuto leggermente. Russell Stover, un'altra compagnia di dolciumi, ha acquistato Farmer nel 1965. La fabbrica di Rochester e il suo flagship store nella città sono stati chiusi in due anni.
Nel 1984, Chocamerican, una holding americana per un'azienda francese, acquistò Fanny Farmer. A quel punto, circa 250 negozi erano sparsi lungo la costa orientale, nel Midwest e in Florida. Chocamerican ha venduto i negozi rimanenti - circa 200 - alla Archibald Candy Corporation nel 1992. Per quell'anno, Fannie Farmer avrebbe dovuto realizzare 40 milioni di dollari di vendite.