Le arachidi organiche vengono coltivate senza fertilizzanti sintetici e pesticidi. La maggior parte delle arachidi organiche viene coltivata nei climi aridi del New Mexico e dell'Arizona per ridurre al minimo la contaminazione delle colture da parte di Aspergillus flavos, uno stampo che porta la tossina cancerogena micotossina Aflatossina e altre muffe.
Gli agricoltori che coltivano arachidi biologiche utilizzano innovative tecniche di gestione del suolo e una rotazione delle colture aggressiva per mantenere sani il suolo e le piante di arachidi. Sia le arachidi organiche che le arachidi non biologiche hanno il potenziale di essere contaminate da muffe o altri organismi quando vengono trasferite dal campo al mercato. Le arachidi possono anche essere contaminate da manipolazione impropria, lavorazione e conservazione con muffe, salmonelle, E. coli e altri organismi.