Il formaggio può essere sciolto mettendolo in un piatto sicuro per microonde e cuocendo a fuoco vivo per un determinato periodo di tempo. La maggior parte delle ricette fornisce istruzioni su come sciogliere determinati tipi di formaggio.
Seguire attentamente le istruzioni della ricetta quando si scioglie il formaggio. Se il formaggio cuoce troppo a lungo, diventa gommoso. Il formaggio troppo cotto viene evitato monitorando da vicino il tempo che cuoce nel microonde. Un buon consiglio è quello di cucinare il formaggio a intervalli di 15 a 30 secondi. In questo modo, il timer può essere regolato se necessario.
I piatti a base di formaggio come i nachos normalmente impiegano circa uno o due minuti per cucinare nel microonde.