Circa 100 specie di piante ed erbe contengono caffeina. La caffeina si trova meno comunemente nei frutti, ma la noce di cola contiene caffeina, così come i semi del frutto della pianta del Guaranà e dell'albero del cacao .
Le piante di guaranà producono piccoli frutti che hanno semi con una maggiore concentrazione di caffeina rispetto ai chicchi di caffè. Alcune specie della pianta della coffea producono frutti commestibili rossi e viola chiamati ciliegie. Queste ciliegie contengono semi che contengono caffeina. Le piante di limone, pompelmo e arancia contengono caffeina nelle foglie e nei fiori, ma non nei frutti stessi.
La maggior parte dei frutti che provengono da piante in fiore non contengono caffeina. La caffeina presente in natura nelle piante e nei semi spesso funge da meccanismo di difesa per scoraggiare gli erbivori dal mangiare la pianta.
