Una torta di pecan non cotta e appena sfornata può essere conservata a temperatura ambiente per due ore prima di essere servita. Se la torta di noci pecan è refrigerata, la conservazione dura fino a quattro giorni.
La torta di noci pecan deve essere refrigerata dopo essere stata tagliata o se è destinata a servire più di due ore dopo la preparazione. Il contenuto di umidità nella torta, così come il contenuto proteico dei suoi ingredienti, può portare a una rapida moltiplicazione dei batteri se la torta viene lasciata a temperatura ambiente.
Una torta di noci pecan può essere conservata nel congelatore per un massimo di due mesi. La torta deve essere conservata in un sacchetto per freezer resistente o avvolta in un involucro di plastica per congelatore o foglio di alluminio prima che sia congelata.