Da un punto di vista scientifico, un pomodoro è un frutto, ma viene trattato come una verdura in cucina. Biologicamente, i pomodori si sviluppano in modo simile a molti frutti, ma i cuochi li usano come verdure nei piatti che non sono dolci.
I pomodori si sviluppano dall'ovaio della pianta, che si trova nel fiore. Alla maturazione, contengono semi, come fanno altri frutti. A loro volta, nelle condizioni corrette, questi semi producono altre piante. Le verdure non si sviluppano dall'ovaia di una pianta, ma sono parti commestibili di quella pianta che, da sole, non producono altre piante. Botanicamente, il pomodoro è nel gruppo di frutti a bacca.