Il sidro di mele si deteriora dopo 6-30 giorni, a seconda della presenza di conservanti, come il sorbato di potassio, che prolunga la durata di conservazione. La maggior parte dei prodotti di sidro commercializzati, ad eccezione delle ricette biologiche, contengono conservanti. Il sidro prodotto dai coltivatori locali potrebbe non contenere conservanti, in base ai requisiti locali e statali.
I sidri che vengono venduti in forma refrigerata devono essere refrigerati in ogni momento per mantenere l'aroma e prevenire il deterioramento precoce. Il sidro che sviluppa un odore sgradevole o un sapore paragonabile all'aceto deve essere scartato. Il sidro di mele può anche essere congelato per un massimo di sei mesi quando viene trasferito in un contenitore ermetico sicuro per il congelatore. La pastorizzazione, che è richiesta dalla Food and Drug Administration degli Stati Uniti, non ha alcun impatto sulla shelf life del sidro di mele.