Sebbene l'aceto non sia efficace come detergenti commerciali, è un disinfettante naturale in grado di uccidere batteri e virus. Le proprietà disinfettanti dell'aceto derivano dall'acido acetico che fa parte della sua composizione, ma questo acido danneggia anche alcuni tipi di superfici, quindi dovrebbe essere usato con cautela.
L'aceto offre i vantaggi di essere biodegradabile, non tossico e poco costoso, quindi è abbastanza sicuro da essere utilizzato anche dai bambini per la pulizia. Tuttavia, non può uccidere tutti i tipi di batteri. Ad esempio, i ricercatori nel Regno Unito hanno scoperto che l'aceto uccide il virus dell'influenza, ma è inefficace contro certi tipi di salmonella.
Per la pulizia e la disinfezione della casa in generale, utilizzare una soluzione 50/50 di acqua per aceto. Alcuni compiti più difficili, come la pulizia della muffa o la disinfezione di superfici porose, possono richiedere una soluzione più forte o puro aceto. È sicuro da usare sulla maggior parte delle superfici domestiche; tuttavia, l'aceto è corrosivo per il marmo a causa della sua acidità. La miscelazione di candeggina e aceto deve essere evitata poiché crea gas cloro, che è tossico.