Non è sicuro mangiare farina cruda. Il bollettino di avvelenamento alimentare avverte che la farina cruda può contenere batteri patogeni e mangiarlo può causare malattie. Oltre a evitare il consumo di qualsiasi farina cruda, è importante trattare la farina cruda allo stesso modo degli altri ingredienti non pericolosi potenzialmente pericolosi. Per evitare la contaminazione incrociata, i cuochi devono sempre disinfettare le superfici esposte alla farina cruda e lavarsi le mani dopo aver maneggiato la farina cruda.
Il New York Times riporta che un'epidemia di E. coli del 2009 è stata fatta risalire al consumo di pasta biscotto commerciale non cotta, pronta per il consumo, e che la farina cruda nell'impasto era probabilmente la causa.
Dr. Karen Neil, un'epidemiologia medica che lavora per i Centri per il controllo e la prevenzione delle malattie, spiega che la farina cruda era l'unico ingrediente agricolo grezzo nella pasta biscotto confezionata non cotta. Perché non ha subito alcun processo per uccidere gli agenti patogeni, probabilmente ha portato alla contaminazione della pasta biscotto. Le uova utilizzate nell'impasto sono state pastorizzate, che uccidono gli agenti patogeni, e lo zucchero, la melassa, la margarina e il bicarbonato di sodio sono stati sottoposti a diversi kill-step di agenti patogeni durante la lavorazione.
Il New York Times riporta che, secondo uno studio del 2008, il 53% degli studenti universitari ha ammesso di aver mangiato pasta biscotto non cotta.
