I potenziali impatti negativi delle biotecnologie includono rischi per gli esseri umani che mangiano alimenti derivati da piante o animali geneticamente modificati e il rischio di danni alle piante e agli ecosistemi nativi da piante geneticamente modificate. C'è anche preoccupazione per gli agricoltori 'Le finanze soffrono quando le multinazionali monopolizzano semi modificati o altri prodotti agricoli.
Le colture geneticamente modificate sono i principali prodotti della biotecnologia agricola. Un'altra preoccupazione è l'uso di ormoni negli animali, come l'ormone della crescita bovino ricombinante artificiale che causa infezioni e altri problemi di salute nelle mucche. Gli studi sono inconcludenti sul fatto che il cancro e altri possibili effetti negativi sulla salute negli esseri umani siano causati dal consumo di prodotti alimentari da animali trattati con ormoni artificiali.
Le colture geneticamente modificate possono contaminare le piante naturali con polline e geni geneticamente modificati, creare nuovi ceppi virali o erbacce, interrompere il controllo dei parassiti naturali e contaminare il suolo con tossine che possono danneggiare la catena alimentare. Queste tossine possono danneggiare i lavoratori agricoli, le loro famiglie e altri nella comunità in cui vengono coltivate colture geneticamente modificate.
Limitare le colture degli agricoltori a un minor numero di varietà geneticamente modificate limita anche la biodiversità, che è importante per la siccità e le malattie che colpiscono le piante. Se ci sono meno varietà o specie in un ecosistema, la popolazione è più vulnerabile a un parassita della monocultura che potrebbe spazzare via un importante alimento nell'alimentazione.
Alcuni paesi in cui gli OGM sono venduti mancano di adeguata supervisione e controllo degli organismi per proteggere le persone e l'ambiente.