Bere succo di mela ammuffito può causare un lieve mal di stomaco o disagio intestinale. Il succo che ha muffe o ha cambiato colore dovrebbe essere scartato.
Il succo di mela in bottiglia ha una durata di conservazione di 2 o 3 mesi dalla data di scadenza. Il succo di mela in scatola non aperto è sicuro da consumare dai 6 ai 9 mesi dopo la data di stampa.
Il succo di mela appena spremuto non deve essere conservato in frigorifero per più di 7-10 giorni. Il succo con un contenuto zuccherino più elevato ha in genere una shelf life più lunga.
Bere succo di mela non pastorizzato comporta un rischio di intossicazione alimentare. La pastorizzazione viene utilizzata per uccidere i batteri nocivi nei succhi e nel latte e, pertanto, il succo di mela non pastorizzato può andare male prima della sua controparte.