Le cause comuni di contaminazione degli alimenti includono batteri, virus e parassiti che entrano nel processo di produzione durante la fase di crescita, raccolta, lavorazione, spedizione o preparazione. Gli alimenti particolarmente sensibili alla contaminazione dannosa includono crudo e pronto cibi pronti da mangiare, come i prodotti, che non vengono cucinati prima del consumo.
E. coli è uno dei contaminanti più comuni ed è il risultato di carne bovina poco cotta che è stata contaminata con le feci durante il suo macello. La contaminazione incrociata del cibo con la salmonella è comune nelle cucine in cui i cuochi manipolano carne cruda e pollame usando strumenti o mani non lavate che gestiscono anche cibi cotti o pronti da mangiare, portando a intossicazioni alimentari per il consumatore.
